🔄 三羧酸循环 (TCA Cycle) 交互式演示

Krebs Cycle / Citric Acid Cycle - 完整代谢路径可视化

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📚 什么是 TCA 循环?

🔬 基本概念

TCA 循环Tricarboxylic Acid Cycle,三羧酸循环)是细胞有氧呼吸的核心代谢途径,也被称为:

  • Krebs 循环(Krebs Cycle)- 以发现者 Hans Krebs 命名
  • 柠檬酸循环(Citric Acid Cycle)- 因其第一个产物是柠檬酸

⚙️ 主要功能

TCA 循环在有氧条件下将 乙酰-CoA 完全氧化为 CO₂,同时产生高能化合物:

  • NADH - 3 分子/循环(部分步骤)
  • FADH₂ - 1 分子/循环
  • GTP(可转化为 ATP)- 1 分子/循环

这些高能化合物随后通过电子传递链产生大量 ATP,是细胞获取能量的关键步骤。

📍 在代谢中的地位

TCA 循环位于细胞线粒体基质中,是连接多种代谢途径的中心枢纽

  • 连接糖酵解(Glycolysis)和氧化磷酸化(Oxidative Phosphorylation)
  • 连接脂肪酸氧化(β-氧化)和氨基酸分解代谢
  • 生物合成提供前体物质(如 α-酮戊二酸、草酰乙酸等)
  • 糖异生(Gluconeogenesis)中发挥重要作用

💡 交互提示

  • 点击圆形节点:查看该分子的详细信息和 2D/3D 分子结构
  • 点击箭头:查看反应的详细机理、原子团变化和反应前后的分子结构对比
  • 滚轮缩放:使用鼠标滚轮或右上角按钮缩放图表
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🧪 3D高亮测试

测试3D高亮功能:使用乙醇(C₂H₅OH)测试,高亮氧原子(索引2)

起始分子
中间产物
能量产物
辅因子
100%

🔬 研究方法与发现历史

🔍 研究代谢过程的方法

1. 放射性同位素示踪法(Radioisotope Tracing)

使用放射性同位素(如14C、3H、15N)标记特定化合物,追踪其在代谢途径中的转化过程。这是发现TCA循环的关键方法。

  • 优点:高灵敏度,可追踪完整代谢路径
  • 应用:确定中间产物和反应顺序

2. 酶学分析(Enzymatic Analysis)

分离和纯化代谢酶,研究其催化机制、底物特异性、动力学参数和调控方式。

  • 方法:酶活性测定、抑制剂研究、晶体结构分析
  • 应用:理解反应机制和调控网络

3. 代谢组学(Metabolomics)

利用质谱(MS)和核磁共振(NMR)等技术,全面分析细胞或组织中所有代谢物的组成和变化。

  • 技术:LC-MS、GC-MS、1H NMR
  • 应用:发现新的代谢物和代谢通路

4. 基因敲除与突变分析(Genetic Knockout & Mutagenesis)

通过基因敲除、RNA干扰或化学诱变,破坏特定酶的活性,观察代谢表型变化。

  • 应用:验证酶的生理功能和代谢通路的重要性
  • 例子:酵母突变体研究揭示了TCA循环的必需性

5. 代谢通量分析(Metabolic Flux Analysis, MFA)

结合同位素标记和数学模型,定量分析代谢网络中各反应的流量分布。

  • 方法:稳定同位素标记、13C-MFA
  • 应用:理解代谢调控和优化生物工程

6. 计算生物学与系统生物学

利用计算机模型和网络分析,预测和模拟代谢途径,整合多组学数据。

  • 工具:代谢网络重建、通路数据库(KEGG、Reactome)
  • 应用:预测新代谢途径、药物靶点发现

📜 TCA循环的发现历史

"The discovery of the citric acid cycle is one of the most significant achievements in biochemistry, revealing how living cells extract energy from nutrients."

🕐 1930年代:早期观察

科学家发现动物组织能够将柠檬酸、琥珀酸、延胡索酸等有机酸氧化为CO₂,但这些化合物如何参与代谢尚不清楚。

关键人物:Albert Szent-Györgyi发现苹果酸、琥珀酸、延胡索酸的催化作用

🔬 1937年:Krebs的突破性发现

Hans Adolf Krebs使用鸽胸肌组织切片,通过添加各种中间产物并测量氧气消耗,发现了循环反应的证据。

关键实验:
• 发现草酰乙酸能够大大促进丙酮酸的氧化
• 证明琥珀酸、延胡索酸、苹果酸、草酰乙酸形成催化循环
• 识别出柠檬酸、α-酮戊二酸、琥珀酰辅酶A等关键中间产物
• 提出"柠檬酸循环"(Citric Acid Cycle)概念

📊 1940-1950年代:同位素示踪验证

使用14C标记的乙酸(乙酰辅酶A前体)和14C标记的丙酮酸,追踪碳原子在循环中的流动,完全验证了Krebs提出的循环机制。

关键发现:
• 确认了循环性质:草酰乙酸既是产物又是反应物
• 证明了两个CO₂的释放位置和来源
• 阐明了NADH、FADH₂和ATP的生成位置

🏆 1953年:诺贝尔奖

Hans Krebs和Fritz Lipmann(发现辅酶A)共同获得1953年诺贝尔生理学或医学奖,表彰他们在细胞代谢领域的开创性贡献。

🔬 1950-1970年代:酶学机制阐明

逐步分离和纯化了所有8个关键酶,研究了它们的催化机制、结构特征和调控方式。关键进展包括:

  • 柠檬酸合酶:发现了"诱导契合"机制
  • 异柠檬酸脱氢酶:揭示了变构调控
  • α-酮戊二酸脱氢酶复合体:阐明了多酶复合体的结构

🧬 现代研究(1980年代至今)

通过X射线晶体学、结构生物学、基因组学和代谢组学,深入理解了TCA循环的三维结构、进化起源、在不同组织中的调控以及与其他代谢途径的整合。

  • 高分辨率酶结构解析
  • 代谢组学和通量分析
  • 疾病相关的代谢异常研究(癌症、糖尿病等)
  • 合成生物学和代谢工程应用

📚 文献与延伸阅读

🔬 经典文献

🌐 在线资源

📖 推荐书籍

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🎓 延伸学习

📝 引用建议: 如果您在学术研究中使用了本页面的内容,请适当引用相关文献。Krebs循环的原始发现文献是研究该主题的重要历史文献。