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AI 驱动的分子设计入门

AI 驱动的分子设计入门

课程简介

本课程系统讲解 AI 如何改变药物发现中的分子设计流程。从传统 HTSGAN/VAE 分子生成,再到最新的 diffusion model 方法,覆盖 AI 分子设计的完整技术栈。

AI 驱动的分子设计工作流程11. 靶点定义确定药物靶点收集已知活性数据22. 模型训练训练预测模型评估验证集性能33. 分子生成GNN/VAE/扩散模型生成候选分子44. 虚拟筛选ADMET 预测毒性/溶解度过滤55. 合成评估逆合成分析可合成性评分66. 实验验证机器人合成生物活性测试闭环优化核心思想:AI 预测 + 实验验证 + 反馈学习 = 迭代加速药物发现

图1:AI 驱动的分子设计闭环工作流程

学习目标

  • 理解 AI 分子设计的六步闭环工作流
  • 掌握分子表征方法的选择策略(SMILES / ECFP / GNN / 3D)
  • 学会使用 RDKit + PyTorch Geometric 构建分子预测模型
  • 了解 retrosynthesis analysis 与可合成性评估
  • 能够评估 AI 生成分子的 ADMET 性质

章节概览

  1. 分子表征基础:SMILES、InChI、ECFP 与图结构
  2. 图神经网络实战:消息传递与图级读出
  3. 生成模型入门:VAE、GAN 与扩散模型在分子生成中的应用
  4. 虚拟筛选与 ADMET 预测
  5. 逆合成分析与可合成性评分
  6. 闭环优化:AI 预测 + 机器人合成 + 反馈学习

适合人群

具备基础 Python 和化学知识的学习者,对 AI 药物发现感兴趣的计算化学、药物化学或生物信息学方向的学生和研究人员。

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