看懂基因开关：顺式调控元件入门与实战
课程简介
人类基因组里编码蛋白质的部分不到 2%，剩下 98% 长期被当成"无用 junk"（垃圾序列）。但过去二十年里，证据越来越一致：那不是垃圾，而是一整套开关——决定每个基因在什么细胞、什么时间、开多大力度。本课程带你把这一层从概念讲到实验，从单个位点的功能讲到大样本量的筛选方法，最后落到"人类演化和疾病为什么常常出在调控区"这个真实问题上。
学习目标
- 说清启动子（promoter）与增强子（enhancer）的区别：位置、时间特异性、作用距离
- 理解顺式调控（cis）与反式调控因子（trans factor）的基本分工
- 读懂一个 MPRA 实验设计：为什么用 56 万个位点做平行报告，为什么要做单点突变
- 掌握大规模筛选里最常见的三类干扰：细胞背景效应、拷贝数效应、报告基因本身的选择压力
- 能用"调控差异"而非"编码差异"来解释一个演化现象，并说出这个解释的边界在哪
章节概览
- 第一章：98% 的"垃圾"——人类基因组计划的遗产误解
- 第二章：启动子：转录的"点火开关"在哪里
- 第三章：增强子：远距离的电压调节器
- 第四章：转录因子与增强子如何"接触"——一个仍未完全解决的物理问题
- 第五章：设计一个 MPRA 实验：56 万个位点怎么问出答案
- 第六章：人-猿杂交细胞：同一环境里做对照的技巧
- 第七章：读懂结果——从"15077 个位点"到功能通路
- 第八章：糖胺聚糖与人类骨骼：演化故事的一个真实案例
- 第九章：调控区变异与疾病：从 CNV 到 eQTL
- 第十章：常用工具与数据库：JASPAR、ENCODE、EnhancerAtlas
- 第十一章：实验验证——从候选位点到真实表型的距离
- 第十二章：结课：你如何为自己的问题设计一次筛选
适合谁
- 生物、统计、计算机背景，想系统补一次调控基因组学基础的同学
- 做功能基因组学/表型研究但对调控区概念模糊的研究者
- 希望理解"编码相同≠功能相同"这个核心洞见的任何读者