为什么需要结构预测
序列功能常藏在三维折叠里
本节你将能
说明结构对功能解释的价值,以及实验结构与预测结构的关系。
直觉模型
序列是乐谱,结构是演奏成形——活性位点往往是空间上靠近的残基。
核心要点
- PDB:实验结构仓库
- 同源建模 vs 深度学习预测
- AlphaFold 改变了可及性与速度
常见误区
把预测结构当成晶体学真理——需看置信度。
动手
在 PDB/AlphaFold DB 打开一个熟悉蛋白页面。
互动
测验:结构预测的输入通常是什么。
本节小结
下一节认识 pLDDT 等置信度。
序列功能常藏在三维折叠里
说明结构对功能解释的价值,以及实验结构与预测结构的关系。
序列是乐谱,结构是演奏成形——活性位点往往是空间上靠近的残基。
把预测结构当成晶体学真理——需看置信度。
在 PDB/AlphaFold DB 打开一个熟悉蛋白页面。
测验:结构预测的输入通常是什么。
下一节认识 pLDDT 等置信度。