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演示知识点练习题

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难度 3

在蛋白质设计(protein design)中,逆折叠(inverse folding)问题是?

难度 3

在单细胞RNA-seq(scRNA-seq)数据分析中,双联体(doublet)是指?

难度 3

在de Bruijn图基因组组装算法中,为什么需要选择适当的k-mer大小(k)?

难度 3

在AlphaFold-Multimer(用于蛋白质复合体预测)中,为什么对界面残基(interface residue)的预测尤为关键?

难度 3

在设计一段用于CRISPR-Cas9基因编辑的sgRNA时,以下哪项是评估脱靶效应(off-target effect)的关键计算步骤?

难度 2

在系统发育分析中,最长公共祖先(LCA)用于?

难度 2

使用samtools view -bS input.sam > output.bam的作用是?

难度 2

在蛋白质结构预测中,pLDDT分数是?

难度 2

在NGS数据中,覆盖深度(coverage depth)指的是?

难度 2

在Biopython中,关于SeqRecord和Seq的关系,正确的是?

难度 2

在RNA-seq数据分析中,RPKM和TPM是用于?

难度 2

AlphaFold 2的核心技术创新是?

难度 2

在Python中处理VCF(变异调用格式)文件,最适合的库是?

难度 2

在系统发育树中,外群(outgroup)的作用是?

难度 2

在Biopython中,record.description和record.id的区别是?

难度 2

在蛋白质结构预测中,模板建模(template-based modeling)指的是?

难度 2

二代测序(NGS)的reads长度通常为?

难度 2

在Python中使用Bio.Align进行多序列比对时,以下哪种算法最常用于渐进式比对?

难度 2

以下关于BAM文件索引(.bai)的说法,正确的是?

难度 2

在Smith-Waterman局部比对算法中,动态规划矩阵的填充规则是?

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