AlphaFold 3.5 与分子互作网络：从单蛋白到生命网络
DeepMind 推出 AlphaFold 3.5，将能力从单蛋白结构扩展到复杂分子互作网络，开启"从单蛋白到生命网络"的结构生物学新阶段。
2026 年 5 月，DeepMind 在《自然》发表 AlphaFold 3.5，这并非简单迭代，而是把人工智能在结构生物学中的边界从"预测单个蛋白"推向"预测分子互作网络"。
演进时间线
图1：从 AF2 单链到 AF3.5 互作网络的演进
从结构到网络
过去，研究者拿到一个蛋白结构已是里程碑；如今，AF 能直接预测蛋白质—核酸—小分子之间的结合姿态，并把成千上万个这样的"节点"连成分子互作网络（interactome）。这让科学家第一次能在计算上"看见"生命机器是如何组装的。
为什么重要
理解互作网络，意味着能更精准地定位药物靶点、理解疾病机制。当结构预测从"点"走向"网"，AI 正在把结构生物学从一门"测量科学"变成一门"设计科学"。
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